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CIFE9
Montpellier
(France)
2018
Résumé R136P
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Version 1.96
24 Juin 2018


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CIFE-CIFE9 - Conférence CIFE9 Montpellier (France) 2018  - Résumé - Page R136
Copyright Jacques-Deric Rouault 2018. ISBN 978-2-907103-10-5.
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Titre

Transfert horizontal des éléments transposables (HTT) entre les pucerons et les céréales ?

Auteur(s)

Maryem Bouallegue (1, 2)
Wafa Ben Lazhar (1)
Maha Mezghani-Khemakhem (1)
Hanem Makni (1, 3)
Pierre Capy (2)
Mohamed Makni (1)


(1) UR Génomique des Insectes Ravageurs des Cultures d’intérêt agronomique (GIRC, UR11ES10), Faculté des Sciences de Tunis, Université de Tunis El Manar, Tunisie
(2) Laboratoire Evolution, Génomes, Comportement, Ecologie (EGCE), Centre National de Recherche Scientifique (CNRS), Gif-sur-Yvette, France
(3) Institut Supérieur de l’Animation pour la Jeunesse et la Culture de Bir-El-Bey, Université de Tunis, 2055, Tunis, Tunisie.

Statut

    Supervision : 0
    Présentation : Poster demandé
    Acceptation : 1

Résumé

    Les éléments transposables de type Tc1-mariner, constituent la plus large super-famille de transposons à ADN. Ils sont caractérisés par leur petite taille (environ 1300 pb), la présence de deux ITR et d'une ORF codant une transposase possédant une triade catalytique DDxD/E.

    Les éléments transposables de type Tc1-mariner, constituent la plus large super-famille de transposons à ADN. Ils sont caractérisés par leur petite taille (environ 1300 pb), la présence de deux ITR et d'une ORF codant une transposase possédant une triade catalytique DDxD/E.

    L’analyse in silico des génomes des trois espèces de pucerons Acyrthosiphon. pisum, Myzus persicae et Diuraphis noxia appartenant à la tribu des Macrosiphini, nous ont permis d’identifier trois clades d’éléments (irritans, rosa et LTIR-like elements). Alors que la sous-famille irritans, subdivisée en trois tribus, est commune aux trois génomes, les clades rosa et LTIR-like elements semblent être plus répandus dans le génome d’A. pisum. Par ailleurs, bien que la sous-famille irritans appartenant à la famille des transposons mariner DD34D, soit largement distribuée au sein des espèces, la majorité de ces éléments ne semble pas fonctionnelle.

    Nous avons utilisé des amorces consensus ITR déduites des résultats d’analyses in silico (Bouallègue et al. 2017) pour  rechercher et caractériser in vitro des éléments de la sous-famille irritans DD34D chez les pucerons des céréales Rhopalosiphum padi, R. maidis, Schizaphis graminum, Sitobion avenae.

    Les résultats obtenus après amplification à l’aide de ces amorces, clonage et séquençage, nous ont permis de mettre en évidence une copie de 950 pb présentant 98% de similitude avec les séquences des éléments de la sous-famille irritans d’A. pisum et ceci chez toutes les espèces de pucerons analysées.

    Etant donnée la relation étroite entre les pucerons et leurs plantes hôtes, nous avons recherché in silico et in vitro ces éléments chez les plantes (Brachypodium distachyon, Triticum sp, Hordeum vulgare et Aegilops tauschii). Pour cela, nous nous sommes focalisés sur les séquences irritans ce qui nous a permis d’identifier in silico (BLASTN) quatre copies partielles (entre 200 pb et 557 pb) chez H. vulgare. Celles-ci présentent entre 72% et 92% de similitude avec les séquences irritans trouvées chez les pucerons. La présence de ces copies chez cette plante a été confirmée in vitro en utilisant les mêmes amorces que celles utilisées chez les pucerons. Plus précisément, nous avons pu identifier une séquence de 640 pb chez H. vulgare (orge) présentant 98% de similitude avec celle du puceron S. avenae. Ce résultat suggère fortement l’existence d’un transfert horizontal de cet élément transposable entre les pucerons et plantes hôtes.


Mots clés

    Pucerons des céréales, plantes hôtes, mariner DD34D, irritans.

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